Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-2Q9BYQ4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP9-2Q9BYQ4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms