Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NICN1Q9BSH3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NICN1Q9BSH3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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