Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRADC1Q9BSG0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms