Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORT1Q99523 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms