Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDRT15Q96T59 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDRT15Q96T59 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms