Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM20AQ96MK3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms