Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms