Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHDQ96IW2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms