Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEURL3Q96EH8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms