Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1LQ96C74 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms