Protein–RNA interactions for Protein: Q96BH1

RNF25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF25Q96BH1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF25Q96BH1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF25Q96BH1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF25Q96BH1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms