Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEIL2Q969S2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEIL2Q969S2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms