Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM1Q8TC05 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms