Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDPRQ8NCN5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms