Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC74

RBBP8NL, RBBP8 N-terminal-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8NLQ8NC74 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8NLQ8NC74 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP8NLQ8NC74 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBBP8NLQ8NC74 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms