Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC63Q8NA47 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms