Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9T2

NKAPP1, Putative uncharacterized protein CXorf42, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKAPP1Q8N9T2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKAPP1Q8N9T2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKAPP1Q8N9T2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms