Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMYD4Q8IYR2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD4Q8IYR2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms