Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT20Q8IY31 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT20Q8IY31 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms