Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC8AQ8IWT6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC8AQ8IWT6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC8AQ8IWT6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC8AQ8IWT6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC8AQ8IWT6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC8AQ8IWT6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC8AQ8IWT6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC8AQ8IWT6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC8AQ8IWT6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC8AQ8IWT6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC8AQ8IWT6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC8AQ8IWT6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC8AQ8IWT6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8AQ8IWT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8AQ8IWT6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms