Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APLFQ8IW19 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APLFQ8IW19 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms