Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM15Q7Z3B0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM15Q7Z3B0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms