Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP2Q7RTS6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP2Q7RTS6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms