Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP9Q7RTR0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP9Q7RTR0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms