Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDHR3Q6ZTQ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDHR3Q6ZTQ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDHR3Q6ZTQ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDHR3Q6ZTQ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDHR3Q6ZTQ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDHR3Q6ZTQ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms