Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms