Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms