Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CARMIL2Q6F5E8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CARMIL2Q6F5E8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
CARMIL2Q6F5E8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms