Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUPD1Q68J44 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms