Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP58Q5T655 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFAP58Q5T655 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP58Q5T655 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP58Q5T655 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP58Q5T655 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP58Q5T655 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms