Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DNAL1Q4LDG9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAL1Q4LDG9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAL1Q4LDG9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms