Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6AP1Q15904 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1Q15904 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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