Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPTX1Q15818 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPTX1Q15818 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms