Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A3R2Q15599 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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