Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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