Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 KNS1YLL019C 2214 nt6.14□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.14□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 YDL129WYDL129W 876 nt6.14□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 TRP1YDR007W 675 nt6.14□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 YNL200CYNL200C 741 nt6.14□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt6.14□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 GUD1YDL238C 1470 nt6.14□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 YEN1YER041W 2280 nt6.14□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 YIL092WYIL092W 1902 nt6.13□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 PXL1YKR090W 2121 nt6.13□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 BMT5YIL096C 1011 nt6.13□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 YNR048WYNR048W 1182 nt6.13□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 YNR068CYNR068C 819 nt6.13□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 HST3YOR025W 1344 nt6.13□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 ISN1YOR155C 1353 nt6.13□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 ISC1YER019W 1434 nt6.13□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 ASN2YGR124W 1719 nt6.13□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 SEM1YDR363W-A 270 nt6.12□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 RAD24YER173W 1980 nt6.12□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 YUR1YJL139C 1287 nt6.12□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 CSL4YNL232W 879 nt6.12□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 NAT5YOR253W 531 nt6.12□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 PYC2YBR218C 3543 nt6.12□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 APM4YOL062C 1476 nt6.11□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.11□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.11□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.11□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.11□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.11□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 YOS9YDR057W 1629 nt6.1□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 ATG4YNL223W 1485 nt6.1□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 YDL172CYDL172C 480 nt6.1□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 MMS21YEL019C 804 nt6.1□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 DMA1YHR115C 1251 nt6.1□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 BCY1YIL033C 1251 nt6.1□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 ASK1YKL052C 879 nt6.1□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 AFG1YEL052W 1530 nt6.09□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 GAT1YFL021W 1533 nt6.09□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 PKC1YBL105C 3456 nt6.09□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 MCM3YEL032W 2916 nt6.09□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 CEF1YMR213W 1773 nt6.09□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 ARP10YDR106W 855 nt6.09□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 DAP1YPL170W 459 nt6.09□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 ATG12YBR217W 561 nt6.09□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 MRPS5YBR251W 924 nt6.09□□□□□ -1.43
LCB4Q12246 ARO10YDR380W 1908 nt6.09□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 RAP1YNL216W 2484 nt6.08□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 MTF2YDL044C 1323 nt6.08□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 PCL10YGL134W 1302 nt6.08□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 SGE1YPR198W 1632 nt6.08□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 HST2YPL015C 1074 nt6.08□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 PRI2YKL045W 1587 nt6.08□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 TEP1YNL128W 1305 nt6.07□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 YDR278CYDR278C 318 nt6.07□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 YGL118CYGL118C 438 nt6.07□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 LEU5YHR002W 1074 nt6.07□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 AIM41YOR215C 558 nt6.07□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 KKQ8YKL168C 2175 nt6.07□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 MRPL24YMR193W 777 nt6.06□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 AAD15YOL165C 432 nt6.06□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 UBC11YOR339C 471 nt6.06□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 MRK1YDL079C 1506 nt6.05□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 PRP2YNR011C 2631 nt6.05□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 RPT3YDR394W 1287 nt6.05□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 RPN11YFR004W 921 nt6.05□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 MRPS12YNR036C 462 nt6.05□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 GPA1YHR005C 1419 nt6.05□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 NMD5YJR132W 3147 nt6.04□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 RGT2YDL138W 2292 nt6.04□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 RSA3YLR221C 663 nt6.04□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 GLN1YPR035W 1113 nt6.04□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 YER147C-AYER147C-A 411 nt6.03□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 YOL079WYOL079W 399 nt6.03□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 MOD5YOR274W 1287 nt6.03□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 YBR284WYBR284W 2394 nt6.03□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 PET112YBL080C 1626 nt6.03□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 DRS1YLL008W 2259 nt6.02□□□□□ -1.44
LCB4Q12246 DON1YDR273W 1098 nt6.02□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 ICS3YJL077C 396 nt6.02□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 CBT1YKL208W 816 nt6.02□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 SSP120YLR250W 705 nt6.02□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 DUS4YLR405W 1104 nt6.02□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 HXT2YMR011W 1626 nt6.02□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 RIO1YOR119C 1455 nt6.02□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 TFC6YDR362C 2019 nt6.01□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 PRP40YKL012W 1752 nt6.01□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 LYS12YIL094C 1116 nt6.01□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 CIS3YJL158C 684 nt6.01□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 MTC2YKL098W 1074 nt6.01□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 TAF4YMR005W 1167 nt6.01□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 GYP8YFL027C 1494 nt6.01□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 YBR138CYBR138C 1575 nt6.01□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 IES1YFL013C 2079 nt6□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 DIT1YDR403W 1611 nt6□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 RRP4YHR069C 1080 nt6□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 DJP1YIR004W 1299 nt6□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 DSE3YOR264W 1293 nt6□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 SPS22YCL048W 1392 nt6□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 PUF3YLL013C 2640 nt6□□□□□ -1.45
LCB4Q12246 YML133CYML133C 4125 nt6□□□□□ -1.45
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