Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.98□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 RPT3YDR394W 1287 nt5.98□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 BCY1YIL033C 1251 nt5.98□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 EFM3YJR129C 1020 nt5.98□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 ICT1YLR099C 1185 nt5.98□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 FSF1YOR271C 984 nt5.98□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 HST3YOR025W 1344 nt5.98□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 VPS72YDR485C 2388 nt5.98□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 POR2YIL114C 846 nt5.97□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 QRI5YLR204W 336 nt5.97□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 RNH201YNL072W 924 nt5.97□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.97□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 YNL200CYNL200C 741 nt5.97□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 HIS7YBR248C 1659 nt5.97□□□□□ -1.45
UBX3Q12229 RAP1YNL216W 2484 nt5.96□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 NCS6YGL211W 1080 nt5.96□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 MED6YHR058C 888 nt5.96□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 DOT5YIL010W 648 nt5.96□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 YPR123CYPR123C 435 nt5.96□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 NHA1YLR138W 2958 nt5.96□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 FRS2YFL022C 1512 nt5.95□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 ERP2YAL007C 648 nt5.95□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 RPS5YJR123W 678 nt5.95□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 YML6YML025C 861 nt5.95□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 GLN1YPR035W 1113 nt5.95□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 MNN5YJL186W 1761 nt5.95□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 UTP6YDR449C 1323 nt5.95□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 IVY1YDR229W 1362 nt5.94□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 SLX5YDL013W 1860 nt5.94□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 ASN1YPR145W 1719 nt5.94□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 CEF1YMR213W 1773 nt5.94□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 RPN11YFR004W 921 nt5.94□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 YOL163WYOL163W 510 nt5.94□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 PZF1YPR186C 1290 nt5.94□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 SEC18YBR080C 2277 nt5.94□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 BNA5YLR231C 1362 nt5.93□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 COX9YDL067C 180 nt5.93□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 MRS1YIR021W 1092 nt5.93□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 MRPS12YNR036C 462 nt5.93□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 ATG4YNL223W 1485 nt5.93□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 MSS116YDR194C 1995 nt5.93□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 SIT1YEL065W 1887 nt5.92□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 PPM1YDR435C 987 nt5.92□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 PHB1YGR132C 864 nt5.92□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 TPK1YJL164C 1194 nt5.92□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.92□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 RAD24YER173W 1980 nt5.92□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 IMA2YOL157C 1770 nt5.92□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 YDR514CYDR514C 1452 nt5.91□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 RIO1YOR119C 1455 nt5.91□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 ARP10YDR106W 855 nt5.91□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 YGL072CYGL072C 360 nt5.91□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.91□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.91□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 IFA38YBR159W 1044 nt5.91□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 UTP4YDR324C 2331 nt5.91□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 PAP1YKR002W 1707 nt5.91□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 DDC1YPL194W 1839 nt5.9□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 ZRT2YLR130C 1269 nt5.9□□□□□ -1.46
UBX3Q12229 MCM3YEL032W 2916 nt5.9□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 STB5YHR178W 2232 nt5.9□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 YDL129WYDL129W 876 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 TIM22YDL217C 624 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 RPE1YJL121C 717 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 HAP3YBL021C 435 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 SCO2YBR024W 906 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 HOS2YGL194C 1359 nt5.89□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 VMS1YDR049W 1899 nt5.88□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 TRP5YGL026C 2124 nt5.88□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 BUD32YGR262C 786 nt5.88□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 MOG1YJR074W 657 nt5.88□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 JJJ3YJR097W 519 nt5.88□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 GCV3YAL044C 513 nt5.88□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 AST1YBL069W 1290 nt5.88□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 YNR040WYNR040W 771 nt5.88□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 NPL6YMR091C 1308 nt5.88□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 RAD3YER171W 2337 nt5.88□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 PYK2YOR347C 1521 nt5.88□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 COX20YDR231C 618 nt5.87□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 LEU5YHR002W 1074 nt5.87□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.87□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 ARO10YDR380W 1908 nt5.87□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 YNL247WYNL247W 2304 nt5.87□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 SKS1YPL026C 1509 nt5.86□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 VPS4YPR173C 1314 nt5.86□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 YMR147WYMR147W 672 nt5.86□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 AVO1YOL078W 3531 nt5.85□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 AIM17YHL021C 1398 nt5.85□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 LYS21YDL131W 1323 nt5.85□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 SOH1YGL127C 384 nt5.85□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 RPS28AYOR167C 204 nt5.85□□□□□ -1.47
UBX3Q12229 VMA4YOR332W 702 nt5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.9 ms