Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YOR200WYOR200W 399 nt6.27□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 MOD5YOR274W 1287 nt6.27□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 HIS7YBR248C 1659 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 PYK2YOR347C 1521 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 COX20YDR231C 618 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 PHB1YGR132C 864 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 BCY1YIL033C 1251 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 ICS3YJL077C 396 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 CIS3YJL158C 684 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 REC114YMR133W 1287 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 IME2YJL106W 1938 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 EMW1YNL313C 2715 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 IMA5YJL216C 1746 nt6.25□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 PPM1YDR435C 987 nt6.25□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 HAP3YBL021C 435 nt6.25□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 OST3YOR085W 1053 nt6.25□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 RAD24YER173W 1980 nt6.25□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 RSA4YCR072C 1548 nt6.25□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 KTR5YNL029C 1569 nt6.24□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 CSC1YLR241W 2349 nt6.24□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 THI4YGR144W 981 nt6.24□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 YLR126CYLR126C 756 nt6.24□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 RGD1YBR260C 2001 nt6.24□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 KKQ8YKL168C 2175 nt6.24□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 HXK2YGL253W 1461 nt6.23□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 ATG4YNL223W 1485 nt6.23□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 YHM2YMR241W 945 nt6.23□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 VHT1YGR065C 1782 nt6.23□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 TEP1YNL128W 1305 nt6.23□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 PRS2YER099C 957 nt6.22□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 LEU5YHR002W 1074 nt6.22□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 YJL211CYJL211C 444 nt6.22□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 TPO3YPR156C 1869 nt6.22□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 PET112YBL080C 1626 nt6.21□□□□□ -1.41
VPS54Q12071 RPT3YDR394W 1287 nt6.21□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 DFM1YDR411C 1026 nt6.21□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt6.21□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 SEN34YAR008W 828 nt6.21□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 COR1YBL045C 1374 nt6.2□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.2□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 UGX2YDL169C 672 nt6.2□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 MRPL1YDR116C 858 nt6.2□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 CCP1YKR066C 1086 nt6.2□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 MRPS12YNR036C 462 nt6.2□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 RMD9YGL107C 1941 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 PRI2YKL045W 1587 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 GPB2YAL056W 2643 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 GPI11YDR302W 660 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 LCP5YER127W 1074 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 SPO7YAL009W 780 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 YML012C-AYML012C-A 378 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 TFB4YPR056W 1017 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 MRPS5YBR251W 924 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 MCM3YEL032W 2916 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 BNS1YGR230W 414 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 PXL1YKR090W 2121 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 YML6YML025C 861 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 SHP1YBL058W 1272 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 GLN1YPR035W 1113 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 AFG1YEL052W 1530 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 FRS2YFL022C 1512 nt6.17□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 YML083CYML083C 1257 nt6.17□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 UBC11YOR339C 471 nt6.17□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 ISN1YOR155C 1353 nt6.17□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 ENP1YBR247C 1452 nt6.16□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 ATG12YBR217W 561 nt6.16□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 PFK2YMR205C 2880 nt6.16□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 NPL6YMR091C 1308 nt6.16□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 KEL1YHR158C 3495 nt6.16□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 YDL023CYDL023C 321 nt6.15□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 YDL144CYDL144C 1071 nt6.15□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 ASK1YKL052C 879 nt6.15□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 OAC1YKL120W 975 nt6.15□□□□□ -1.42
VPS54Q12071 EEB1YPL095C 1371 nt6.15□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 YHL017WYHL017W 1599 nt6.14□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 ESC8YOL017W 2145 nt6.14□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 PGK1YCR012W 1251 nt6.14□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 SNN1YNL086W 309 nt6.14□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 RDL2YOR286W 450 nt6.14□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 COX9YDL067C 180 nt6.12□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 MRK1YDL079C 1506 nt6.12□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 ALT2YDR111C 1524 nt6.12□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.12□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.12□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.12□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 EGD2YHR193C 525 nt6.12□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 IMA2YOL157C 1770 nt6.12□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 AAD15YOL165C 432 nt6.12□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 PKC1YBL105C 3456 nt6.11□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 ASN1YPR145W 1719 nt6.11□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 APE3YBR286W 1614 nt6.11□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 CNE1YAL058W 1509 nt6.11□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 HAS1YMR290C 1518 nt6.11□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 CSM2YIL132C 642 nt6.11□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 EFM3YJR129C 1020 nt6.11□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 YOL163WYOL163W 510 nt6.11□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 YOL036WYOL036W 2286 nt6.11□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 GIT1YCR098C 1557 nt6.1□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 DEF1YKL054C 2217 nt6.1□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 YDR109CYDR109C 2148 nt6.1□□□□□ -1.43
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