Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt7.14□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt7.14□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt7.14□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 PAN6YIL145C 930 nt7.14□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 PRM10YJL108C 1152 nt7.14□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 KNS1YLL019C 2214 nt7.14□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 YPL277CYPL277C 1464 nt7.14□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 MRPL36YBR122C 534 nt7.14□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 VMA2YBR127C 1554 nt7.13□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 RPS9AYPL081W 594 nt7.13□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 SSO1YPL232W 873 nt7.13□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt7.12□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 COA1YIL157C 594 nt7.12□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 PGM1YKL127W 1713 nt7.11□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 RRP4YHR069C 1080 nt7.11□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 ICS3YJL077C 396 nt7.11□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 YPL062WYPL062W 405 nt7.11□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 ATG4YNL223W 1485 nt7.11□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 YDR154CYDR154C 351 nt7.1□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 FHN1YGR131W 525 nt7.1□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 YHC3YJL059W 1227 nt7.1□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 MRPL13YKR006C 795 nt7.1□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.1□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 YOR342CYOR342C 960 nt7.1□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 BIM1YER016W 1035 nt7.09□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 YDR278CYDR278C 318 nt7.08□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 YIR042CYIR042C 711 nt7.08□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 DUS4YLR405W 1104 nt7.08□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 YHM2YMR241W 945 nt7.08□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 GUD1YDL238C 1470 nt7.08□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 YML133CYML133C 4125 nt7.08□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 CSC1YLR241W 2349 nt7.07□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 GUT1YHL032C 2130 nt7.07□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 QNS1YHR074W 2145 nt7.07□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 HAL5YJL165C 2568 nt7.07□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 YCL065WYCL065W 369 nt7.07□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 YRA1YDR381W 681 nt7.07□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt7.07□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 PSY4YBL046W 1326 nt7.06□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 CIT3YPR001W 1461 nt7.06□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 CIS3YJL158C 684 nt7.06□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 YNL019CYNL019C 855 nt7.06□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 YNL033WYNL033W 855 nt7.06□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 MOD5YOR274W 1287 nt7.06□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 GLN1YPR035W 1113 nt7.06□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 RPL21AYBR191W 483 nt7.06□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 RRP45YDR280W 918 nt7.05□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 BCY1YIL033C 1251 nt7.05□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 YNR042WYNR042W 429 nt7.04□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 CEF1YMR213W 1773 nt7.04□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 STB5YHR178W 2232 nt7.04□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 VPS61YDR136C 573 nt7.03□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 GIR2YDR152W 798 nt7.03□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 DAL82YNL314W 768 nt7.03□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 IMA5YJL216C 1746 nt7.03□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 SHM1YBR263W 1473 nt7.03□□□□□ -1.28
CTI6Q08923 YOL036WYOL036W 2286 nt7.02□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YAP1801YHR161C 1914 nt7.02□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 RGD1YBR260C 2001 nt7.02□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YEA6YEL006W 1008 nt7.02□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt7.02□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 SUP19tS(UGA)E 82 nt7.02□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 SUP17tS(UGA)I 82 nt7.02□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 SUP16tS(UGA)P 82 nt7.02□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YLR118CYLR118C 684 nt7.02□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 SNU71YGR013W 1863 nt7.02□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 KKQ8YKL168C 2175 nt7.02□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 FET4YMR319C 1659 nt7.01□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 DMA1YHR115C 1251 nt7.01□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YML083CYML083C 1257 nt7.01□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 APE3YBR286W 1614 nt7.01□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 ORC5YNL261W 1440 nt7.01□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YBR284WYBR284W 2394 nt7.01□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 PDR18YNR070W 4002 nt7□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YDR109CYDR109C 2148 nt7□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YDL114WYDL114W 927 nt7□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YGR176WYGR176W 348 nt7□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YLR283WYLR283W 945 nt7□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YMR010WYMR010W 1218 nt7□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 BSC4YNL269W 396 nt7□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 EFM3YJR129C 1020 nt6.99□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 DAL7YIR031C 1665 nt6.99□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 PRP24YMR268C 1335 nt6.99□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YGR182CYGR182C 354 nt6.98□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YNL165WYNL165W 1221 nt6.98□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt6.98□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 GAA1YLR088W 1845 nt6.98□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 TIM54YJL054W 1437 nt6.98□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 GPI11YDR302W 660 nt6.97□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 SHO1YER118C 1104 nt6.97□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 RIO1YOR119C 1455 nt6.97□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 NOB1YOR056C 1380 nt6.96□□□□□ -1.29
CTI6Q08923 GPB2YAL056W 2643 nt6.96□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 YGL235WYGL235W 537 nt6.96□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt6.96□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 CSM2YIL132C 642 nt6.96□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 PGU1YJR153W 1086 nt6.96□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 GLE1YDL207W 1617 nt6.96□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 GYP8YFL027C 1494 nt6.96□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 YML6YML025C 861 nt6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.7 ms