Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX9Q08211 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX9Q08211 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms