Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CALD1Q05682 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
CALD1Q05682 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms