Protein–RNA interactions for Protein: Q04602

VBA4, Vacuolar basic amino acid transporter 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA4Q04602 Q0144Q0144 330 nt5.95□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 SWD1YAR003W 1281 nt5.95□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 AVO1YOL078W 3531 nt5.95□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 SCP1YOR367W 603 nt5.95□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 YDR514CYDR514C 1452 nt5.95□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 PXL1YKR090W 2121 nt5.95□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 ARO9YHR137W 1542 nt5.94□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 GPT2YKR067W 2232 nt5.94□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 LCL3YGL085W 825 nt5.94□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 CBR1YIL043C 855 nt5.94□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 ASF1YJL115W 840 nt5.94□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 YNL200CYNL200C 741 nt5.94□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 YOL050CYOL050C 321 nt5.94□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 TMA46YOR091W 1038 nt5.94□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 SEC62YPL094C 825 nt5.94□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 CRF1YDR223W 1404 nt5.93□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 YCR099CYCR099C 468 nt5.93□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 YDL177CYDL177C 513 nt5.93□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 YUR1YJL139C 1287 nt5.93□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 ATP12YJL180C 978 nt5.93□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 YLR036CYLR036C 612 nt5.93□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 CUE4YML101C 354 nt5.93□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 AVT4YNL101W 2142 nt5.93□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 VHS1YDR247W 1386 nt5.93□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 TKL1YPR074C 2043 nt5.92□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 ISC1YER019W 1434 nt5.92□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 TRS31YDR472W 852 nt5.92□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 SKI8YGL213C 1194 nt5.92□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 OAC1YKL120W 975 nt5.92□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 YKR073CYKR073C 321 nt5.92□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 COX17YLL009C 210 nt5.92□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 PSR1YLL010C 1284 nt5.92□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 AIM33YML087C 939 nt5.92□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 TAF9YMR236W 474 nt5.92□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 LSC1YOR142W 990 nt5.92□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 ADH5YBR145W 1056 nt5.92□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 GEX2YKR106W 1848 nt5.91□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.91□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 YSC83YHR017W 1158 nt5.91□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 FMO1YHR176W 1299 nt5.91□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 GCN3YKR026C 918 nt5.91□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 YBR113WYBR113W 483 nt5.91□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 SUB2YDL084W 1341 nt5.91□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 CLB5YPR120C 1308 nt5.91□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 YIL086CYIL086C 309 nt5.9□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 YKL102CYKL102C 306 nt5.9□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 MRPS18YNL306W 654 nt5.9□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 AME1YBR211C 975 nt5.9□□□□□ -1.46
VBA4Q04602 PPM2YOL141W 2088 nt5.9□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 VRP1YLR337C 2454 nt5.9□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 CEF1YMR213W 1773 nt5.9□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 HOS1YPR068C 1413 nt5.9□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YHR020WYHR020W 2067 nt5.89□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 CDC34YDR054C 888 nt5.89□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 HIS1YER055C 894 nt5.89□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.89□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 ATG36YJL185C 882 nt5.89□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 MHO1YJR008W 1017 nt5.89□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YJR107WYJR107W 987 nt5.89□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 EFM3YJR129C 1020 nt5.89□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt5.89□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YNL092WYNL092W 1203 nt5.89□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 VAM3YOR106W 852 nt5.89□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YBR027CYBR027C 333 nt5.89□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 PDB1YBR221C 1101 nt5.89□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 DOT1YDR440W 1749 nt5.88□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YDR541CYDR541C 1035 nt5.88□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 SSK1YLR006C 2139 nt5.88□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 CTR3YLR411W 726 nt5.88□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 MRPL4YLR439W 960 nt5.88□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YPL168WYPL168W 1293 nt5.88□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 ILV6YCL009C 930 nt5.88□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 AFG1YEL052W 1530 nt5.88□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 GEX1YCL073C 1848 nt5.88□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YPR204WYPR204W 3099 nt5.88□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 ARG81YML099C 2643 nt5.87□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 IMG1YCR046C 510 nt5.87□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YGL101WYGL101W 648 nt5.87□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 CTR2YHR175W 570 nt5.87□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 AIM20YIL158W 615 nt5.87□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YKL077WYKL077W 1179 nt5.87□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 DOM34YNL001W 1161 nt5.87□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YNL108CYNL108C 813 nt5.87□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 NOP13YNL175C 1212 nt5.87□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 UBA3YPR066W 900 nt5.87□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 ISA2YPR067W 558 nt5.87□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YBR284WYBR284W 2394 nt5.86□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 GIT1YCR098C 1557 nt5.86□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YHK8YHR048W 1545 nt5.86□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 COQ1YBR003W 1422 nt5.86□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 SES1YDR023W 1389 nt5.86□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 GCG1YER163C 699 nt5.86□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YLF2YHL014C 1218 nt5.86□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YHR022CYHR022C 771 nt5.86□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt5.86□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YKR032WYKR032W 315 nt5.86□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 PFA4YOL003C 1137 nt5.86□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt5.86□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 GUP2YPL189W 1830 nt5.85□□□□□ -1.47
VBA4Q04602 MKC7YDR144C 1791 nt5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 66.2 ms