Protein–RNA interactions for Protein: Q04511

UFO1, Ubiquitin ligase complex F-box protein UFO1, yeastyeast

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFO1Q04511 YDR015CYDR015C 240 nt6.35□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.35□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.35□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.35□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.35□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.35□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 TIF2YJL138C 1188 nt6.35□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 TIF1YKR059W 1188 nt6.35□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 ICT1YLR099C 1185 nt6.35□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 URE2YNL229C 1065 nt6.35□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 YNL285WYNL285W 372 nt6.35□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 GAA1YLR088W 1845 nt6.34□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 MDM31YHR194W 1740 nt6.34□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 ELP3YPL086C 1674 nt6.34□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 RPT3YDR394W 1287 nt6.34□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 TSA1YML028W 591 nt6.34□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 YNL200CYNL200C 741 nt6.34□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 CYC8YBR112C 2901 nt6.34□□□□□ -1.39
UFO1Q04511 TRP5YGL026C 2124 nt6.34□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 PRP24YMR268C 1335 nt6.33□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 HST3YOR025W 1344 nt6.33□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 KKQ8YKL168C 2175 nt6.33□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 CDC10YCR002C 969 nt6.33□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 PGK1YCR012W 1251 nt6.33□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 YEL068CYEL068C 333 nt6.33□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 LDS1YAL018C 978 nt6.33□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 CNE1YAL058W 1509 nt6.33□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 YOL036WYOL036W 2286 nt6.33□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 HXT2YMR011W 1626 nt6.32□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 YDL218WYDL218W 954 nt6.32□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 TRP1YDR007W 675 nt6.32□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.32□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 FZF1YGL254W 900 nt6.32□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 BCY1YIL033C 1251 nt6.32□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 LYS12YIL094C 1116 nt6.32□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 CAF40YNL288W 1122 nt6.32□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 FSF1YOR271C 984 nt6.32□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 ICL1YER065C 1674 nt6.32□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 JNM1YMR294W 1122 nt6.31□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 RNH201YNL072W 924 nt6.31□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 GLN1YPR035W 1113 nt6.31□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 YPR114WYPR114W 948 nt6.31□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 CTR1YPR124W 1221 nt6.31□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 YLL067CYLL067C 3618 nt6.31□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 MED6YHR058C 888 nt6.3□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 YML6YML025C 861 nt6.3□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt6.3□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 YOL079WYOL079W 399 nt6.3□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 YOL163WYOL163W 510 nt6.3□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 MRPS16YPL013C 366 nt6.3□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 HXT17YNR072W 1695 nt6.3□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 MNN5YJL186W 1761 nt6.29□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 YNL234WYNL234W 1281 nt6.29□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 MRPS12YNR036C 462 nt6.29□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 YPR123CYPR123C 435 nt6.29□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 MRPL36YBR122C 534 nt6.29□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 FRS2YFL022C 1512 nt6.29□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 MSS1YMR023C 1581 nt6.28□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 COX9YDL067C 180 nt6.28□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 PHB1YGR132C 864 nt6.28□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 DOT5YIL010W 648 nt6.28□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 CDC11YJR076C 1248 nt6.28□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 ZRT2YLR130C 1269 nt6.28□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 CEF1YMR213W 1773 nt6.28□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 BUD9YGR041W 1644 nt6.28□□□□□ -1.4
UFO1Q04511 LYS21YDL131W 1323 nt6.27□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 IRS4YKR019C 1848 nt6.27□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 UTP4YDR324C 2331 nt6.27□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 PPM1YDR435C 987 nt6.27□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 ERP5YHR110W 639 nt6.27□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 LSM12YHR121W 564 nt6.27□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.27□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 RSA3YLR221C 663 nt6.27□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 RAP1YNL216W 2484 nt6.27□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 HXK2YGL253W 1461 nt6.27□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 ENP1YBR247C 1452 nt6.27□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 CHS5YLR330W 2016 nt6.26□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 MCM3YEL032W 2916 nt6.26□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 RPN11YFR004W 921 nt6.26□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 RAI1YGL246C 1164 nt6.26□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 RPS5YJR123W 678 nt6.26□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 ATG4YNL223W 1485 nt6.26□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 MRS1YIR021W 1092 nt6.25□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt6.25□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.25□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 NDJ1YOL104C 1059 nt6.25□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 IFA38YBR159W 1044 nt6.25□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 YDR514CYDR514C 1452 nt6.25□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 SVF1YDR346C 1446 nt6.25□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 YBR138CYBR138C 1575 nt6.24□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 RIO1YOR119C 1455 nt6.24□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 YDR401WYDR401W 564 nt6.24□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 HAP3YBL021C 435 nt6.24□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 YNL017CYNL017C 339 nt6.24□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 SKI2YLR398C 3864 nt6.24□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 RAD24YER173W 1980 nt6.24□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 STB5YHR178W 2232 nt6.23□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6.23□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 RRP46YGR095C 672 nt6.22□□□□□ -1.41
UFO1Q04511 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms