Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHLH2Q02577 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms