Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGCS1Q01581 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCS1Q01581 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1286.7 ms