Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DEFA6Q01524 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.6 ms