Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPCAP84074 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPCAP84074 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAP84074 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAP84074 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAP84074 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAP84074 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAP84074 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAP84074 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAP84074 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAP84074 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAP84074 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPCAP84074 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPCAP84074 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPCAP84074 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPCAP84074 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPCAP84074 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPCAP84074 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPCAP84074 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPCAP84074 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPCAP84074 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPCAP84074 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPCAP84074 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPCAP84074 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPCAP84074 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPCAP84074 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPCAP84074 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPCAP84074 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPCAP84074 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPCAP84074 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPCAP84074 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPCAP84074 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HPCAP84074 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPCAP84074 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPCAP84074 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPCAP84074 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPCAP84074 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPCAP84074 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPCAP84074 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPCAP84074 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPCAP84074 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPCAP84074 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HPCAP84074 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPCAP84074 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPCAP84074 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPCAP84074 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPCAP84074 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPCAP84074 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPCAP84074 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPCAP84074 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPCAP84074 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPCAP84074 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPCAP84074 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPCAP84074 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPCAP84074 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPCAP84074 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPCAP84074 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPCAP84074 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPCAP84074 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPCAP84074 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPCAP84074 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPCAP84074 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HPCAP84074 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPCAP84074 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPCAP84074 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPCAP84074 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPCAP84074 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPCAP84074 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPCAP84074 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPCAP84074 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPCAP84074 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPCAP84074 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPCAP84074 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPCAP84074 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAP84074 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAP84074 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAP84074 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAP84074 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAP84074 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAP84074 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAP84074 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAP84074 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAP84074 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAP84074 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAP84074 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAP84074 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms