Protein–RNA interactions for Protein: P62979

RPS27A, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27AP62979 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS27AP62979 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS27AP62979 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms