Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CXCR4P61073 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCR4P61073 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCR4P61073 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms