Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3BP55884 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms